对转录组进行比较分析,并确定了参与Rheum officinale Baill中 antraquinone生物合成的候选bZIP转录因子
Jing Tang1, Yi-Min Li1, Yan Wang2
1Key Laboratory for Research and Development of "Qin Medicine" of Shaanxi Administration of Traditional Chinese Medicine, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi'an 712046, China; College of Pharmacy and Shaanxi Qinling Application Development and Engineering Center of Chinese Herbal Medicine, Shaanxi University of Chinese Medicine, Xi'an 712046, China; State Key Laboratory of Research and Development of Characteristic Qin Medicine Resources (Cultivation), Shaanxi University of Chinese Medicine, Xianyang 712083, China.
Genomics
|October 9, 2024
概括
拉巴巴是一种拉巴巴.
科学领域:
- 植物生物化学 植物生物化学
- 分子生物学分子生物学
- 药理学 药理学是指药理学的学科.
背景情况:
- 鲁巴巴 (Rheum officinale) 是一种传统的中国医药.
- 它的药用特性归因于 antraquinones.
- 在瑞巴巴中,人麻素生物合成调节的理解很少.
研究的目的:
- 为了确定关键的基因和调节机制,涉及到拉巴的氨酸生物合成.
- 为了研究基本素拉链 (bZIP) 转录因子在这个过程中的作用.
主要方法:
- 单分子实时 (SMRT) 测序用于全长的转录组组件.
- 下一代测序 (NGS) 用于识别差异表达基因 (DEG).
- 生物信息分析包括差异表达,协同表达和蛋白质相互作用.
主要成果:
- 在 antraquinone 生物合成途径 (shikimate, polyketide, MVA, MEP) 中确定了 274 个 unigenes.
- 发现了关键的bZIP转录因子RobZIP50和RobZIP53,与 antraquinone生物合成有关.
- RobZIP50和RobZIP53在根/根茎中表达高,在MeJA治疗后增加,并局部化到细胞核.
结论:
- 罗布ZIP53表现出显著的转录活性,并可能调节R. officinale. officinale. 中的 antraquinone 生物合成.
- 这项研究提供了关于药用胡卜中 antraquinone 生产的分子机制的见解.
