2种登革热病毒3型血清型的同时共流传,导致2023年斯里兰卡发生大规模疫情
Dinuka Ariyaratne1, Bhagya Senadheera1, Heshan Kuruppu1
1Allergy Immunology and Cell Biology Unit, Department of Immunology and Molecular Medicine, University of Sri Jayewardenepura, Nugegoda, Sri Lanka.
The Journal of infectious diseases
|October 10, 2024
概括
斯里兰卡有两种登革热病毒 (DENV) 基因型 (I和III) 流传,其中基因型I因关键突变而逃避分子诊断. 这凸显了持续DENV监测的必要性,以检测诊断逃逸和毒性变化.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 分子生物学分子生物学
- 流行病学 流行病学
背景情况:
- 在登革热NS1抗原测试和分子诊断之间发现了差异.
- 在斯里兰卡观察到登革热病毒 (DENV) 血清型3病例的增加.
- 分子诊断的高失败率促使进一步调查.
研究的目的:
- 调查斯里兰卡DENV-3病例增加的原因.
- 了解DENV-3分子诊断测试的高失败率.
- 分析循环DENV-3菌株的遗传多样性和进化动态.
主要方法:
- 22个DENV-3样本的全基因组测序.
- 基因组学和分子时钟分析用于基因型分配和进化速率估计.
- 突变分析以确定影响诊断检测的遗传变异.
主要成果:
- 两种DENV-3基因型 (I和III) 被发现是共循环的.
- 疾病预防控制中心的原型检测器检测到DENV-3基因型III菌株,而I基因型由于原型结合部位的突变而逃避检测.
- 斯里兰卡的DENV-3菌株表现出高突变率,由高根到尖的比率表明.
结论:
- 多个DENV基因型的同时流通与登革热病例的增加有关.
- 在DENV-3基因型I中的关键突变可能导致诊断测试失败.
- 持续监测对于监测DENV演变,诊断逃逸和毒性变化至关重要.
