在骨肌肉中转录和蛋白质水平的空间分析
Paola Pisterzi1, Clara Martinez Mir1, Ouafa Dahri1
1Department of Anatomy and Embryology, Leiden University Medical Center, 2333 Leiden, the Netherlands; The Novo Nordisk Foundation Center for Stem Cell Medicine (reNEW), Leiden Node, the Netherlands.
STAR protocols
|October 10, 2024
概括
骨肌肉不均,显示区域性基因表达. 这项研究详细介绍了一项用于对小鼠肌肉组织中转录和蛋白质水平的空间分析的协议,可适应其他组织.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 人体解剖学 解剖学 解剖学
- 生物化学 生化学
背景情况:
- 骨肌肉在历史上被视为一种统一的组织.
- 最近的空间分析揭示了骨肌肉内基因表达的显著区域差异.
- 这些发现挑战了关于肌肉均性的传统理解.
研究的目的:
- 介绍一个详细的协议,用于空间分析的转录和蛋白质水平在小鼠骨肌肉.
- 为研究人员提供一种可复制的方法,用于研究肌肉组织中的区域基因表达.
- 为进一步研究肌肉异质性的功能影响奠定基础.
主要方法:
- 在小鼠的前肌肉的剖析.
- 用组织切割机固定甲和切割组织.
- 杂交连锁反应 (HCR) 用于转录检测和放大.
- 针对蛋白质局部化的免疫抑制.
- 组织清除和先进的成像技术.
主要成果:
- 该协议使骨肌内基因和蛋白质表达的同时空间分析成为可能.
- 证明了跨肌肉区域的分子标记物的高分辨率映射的可行性.
- 突出了在被清除的小鼠肌肉组织中成功应用HCR和免疫染.
结论:
- 本协议提供了一种强大的方法,用于骨肌肉的空间转录和蛋白质组分析.
- 这种技术有助于在分子水平上研究组织异质性.
- 该协议的适应性使得它在骨肌肉以外的各种生物组织中具有价值.
