单细胞地图揭示了跨瘤类型的多层代谢异质性
Zhe Zhou1, Di Dong1, Yuyao Yuan1
1Institute of Systems Biomedicine, Department of Pathology, School of Basic Medical Sciences, Peking University Health Science Centre and School of Life Sciences, Peking University, Beijing 100191, China.
EBioMedicine
|October 11, 2024
概括
这项研究揭示了癌细胞代谢在瘤内如何变化,确定了与药物耐药性和患者存活相关的特定代谢模式. 这些发现为针对瘤代谢的个性化癌症疗法铺平了道路.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 系统生物学 系统生物学
- 代谢学 代谢学 代谢学
背景情况:
- 代谢重编程对于癌症的进展和瘤内部异质性至关重要.
- 在不同癌症类型中,对不同癌症类型的代谢异质性的有限的单细胞水平表征存在.
研究的目的:
- 在多种癌症类型的单细胞水平上系统地表征代谢异质性.
- 为了确定细胞类型特定的代谢特性和重编程模式.
- 探索细胞代谢特性在癌症中的临床相关性.
主要方法:
- 整合了来自6种癌症类型的296种瘤和正常样本的单细胞代谢基因表达特征.
- 使用非负矩阵因子化 (NMF) 来识别代谢元程序 (MMP).
- 进行了体外实验和生存分析,以验证发现并评估临床相关性.
主要成果:
- 在细胞类型之间确定了糖解的共享上调和酸循环的分歧调节.
- 发现了一种结肠直肠癌特异性MMP,与对elesclomol (cuproptosis诱导剂) 的耐药性相关.
- 根据细胞类型特定的代谢性质,包括髓状细胞,将患者分为预后亚型.
结论:
- 提供了对癌症多层代谢异质性的细微了解.
- 提供了针对瘤代谢的个性化治疗方法的见解,以改善患者的治疗结果.
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