乳腺癌中非编码RNA衍生微的基学和基于机器学习的评估:表达模式和功能/治疗见解
Alexandre Luiz Korte de Azevedo1, Talita Helen Bombardelli Gomig1, Michel Batista2
1Genetics Post-Graduation Program, Genetics Department, Federal University of Paraná, Curitiba, Brazil.
概括
非编码RNA (ncRNA) 衍生微 (MPs) 显示出作为乳腺癌生物标志物和治疗药物的前景. 这项研究确定了58个表达的MP,其中27个在瘤和正常组织之间存在差异,突出了它们在癌症分类和治疗方面的潜力.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 乳腺癌是一种异质性疾病,具有多种不同的分子亚型.
- 非编码RNA (ncRNA) 衍生微 (MP) 正在成为癌症生物学中的关键参与者.
- 有限的大规模研究已经探索了在乳腺癌中的ncRNA衍生MPs,在基水平.
研究的目的:
- 在乳腺癌亚型中研究ncRNA衍生的MPs的表达和功能.
- 为了确定潜在的MP生物标志物用于乳腺癌分类.
- 评估ncRNA衍生MPs在乳腺癌中的治疗潜力.
主要方法:
- 构建一个包含16349个假定的ncRNA衍生MP序列的综合数据集.
- 乳腺瘤和非瘤样本的高通量质谱分析.
- 机器和深度学习工具 (AntiCP 2.0,MULocDeep,PEPstrMOD,Peptipedia,PreAIP) 的应用用于功能和结构预测.
主要成果:
- 在乳腺组织中鉴定了58个表达的MPs,其中27个在瘤中差异表达.
- 发现瘤特异性和亚型特异性MPs.
- 预测的功能包括瘤免疫环境的调节,细胞通信,新陈代谢和信号传递.
- 一些国会议员显示出潜在的抗癌,抗炎和抗血管原性质.
结论:
- 来自ncRNA的MPs表现出与乳腺癌亚型和瘤特异性相关的明显表达模式.
- 这些MP具有作为乳腺癌分子分类生物标志物的巨大潜力.
- MPs是参与瘤发生的生物活性分子,是基于的治疗方法的有希望的候选者.
