在基于生物信息分析的阿尔茨海默病中识别与cuproptosis相关的基因
Ming-Ming Ma1, Jing Zhao1, Ling Liu2
1Neurology, Hangzhou Red Cross Hospital, No. 208, East Huan Cheng Road, Gongshu District, Hangzhou, 310003, Zhejiang, China.
European journal of medical research
|October 12, 2024
概括
质亡是一种新的细胞死亡途径,显示出预测阿尔茨海默病 (AD) 的潜力. 与cuproptosis相关的MAP2K1,SLC31A1和PDHB等枢纽基因可能作为AD的诊断生物标志物.
科学领域:
- 神经科学是一个神经科学.
- 细胞生物学 细胞生物学
- 生物化学 生物化学
背景情况:
- 阿尔茨海默病 (AD) 是一种进展性神经退行性疾病,具有复杂的发病因子.
- 了解像cuproptosis这样的新型细胞死亡机制对于识别AD的新治疗标和诊断标记至关重要.
研究的目的:
- 为了调查cuproptosis在阿尔茨海默病的背景下潜在的作用.
- 为了确定与cuproptosis相关的基因和涉及AD病变发生的途径.
- 根据cuproptosis和apoptosis途径开发和验证AD的预测模型.
主要方法:
- 在AD微阵列数据集 (GSE140830) 上使用加权基因共同表达网络分析来识别关键模块基因.
- 进行了Venn分析,以在亡和亡模块之间找到重叠的基因.
- 构建了蛋白质-蛋白质相互作用网络,确定了枢纽基因,并使用亡和亡相关基因为AD建立了预测模型.
- 使用ROC,DCA,子组分析和独立数据集 (GSE26927) 验证模型性能.
主要成果:
- 在AD中确定了42个与亡相关的和9个与亡相关的模块基因.
- 鉴定出MAPK信号通路是亡和亡相关基因的共同通路.
- 鉴定了细胞亡 (TRADD,FADD,BIRC2,CASP2) 和亡 (MAP2K1,SLC31A1,PDHB) 的枢纽基因.
- 无论是亡还是亡模型都显示出对AD的可比预测能力,由ROC,DCA和子组分析验证.
结论:
- 开发的cuproptosis模型在预测阿尔茨海默病方面表现出显著的潜力.
- 三种特定的枢纽基因MAP2K1,SLC31A1和PDHB与阿尔茨海默病中的型亡密切相关,可以作为诊断和治疗的有价值的生物标志物.
