1994年至2018年在乌干达南部的HIV亚型内部和亚型间的多样性:基于人口的纵向研究
Seungwon Kim1, Godfrey Kigozi2, Michael A Martin1
1Department of Pathology, Johns Hopkins School of Medicine, 600 N. Wolfe Street, Baltimore, MD 21205, United States.
Virus evolution
|October 14, 2024
概括
乌干达的人类免疫缺陷病毒 (HIV) 演变显示病毒多样性增加和重组形式的增加,尽管有预防计划. 这凸显了持续分子监测的必要性,以了解艾滋病毒的动态,并为控制策略提供信息.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 流行病学 流行病学
- 人口遗传学 人口遗传学
背景情况:
- 关于非洲人群中人类免疫缺陷病毒 (HIV) 进化趋势的数据有限.
- 了解艾滋病毒的演变对于有效的流行病控制和疫苗开发至关重要.
研究的目的:
- 评估24年来乌干达南部HIV病毒多样性和遗传差异的变化.
- 评估与预防和治疗计划相关的艾滋病毒进化动态.
主要方法:
- 来自Rakai社区队列研究 (1994-2018) 的HIVGag (p24) 和env (gp41) 序列的分析.
- 遗传学分析以确定艾滋病毒亚型,并使用香农多样性指数,核酸多样性和TN93遗传距离来评估亚型之间的和亚型内的多样性.
- 基于凝聚的贝叶斯天网模型来推断人口历史和进化动态.
主要成果:
- 在内陆社区观察到艾滋病毒亚型A1比例的显著增加和亚型D比例的下降.
- 再组合HIV病毒的比例几乎增加了四倍,从12.2%增加到44.8%.
- 在人口和行为亚组中,病毒多样性在亚型之间和亚型内都增加了,而gp41亚型内的多样性和分歧在2017年增加.
结论:
- 乌干达南部的艾滋病毒进化动态发生了转变,病毒多样性和重组增加.
- 这些变化与实施和扩大艾滋病毒预防和治疗计划的同时发生.
- 持续的分子监测对于了解艾滋病毒的演变和指导疫情控制工作和疫苗开发至关重要.
