无,快速和准确地分析疫情基因组数据,使用分割k-mer分析

Romain Derelle1, Johanna von Wachsmann2, Tommi Mäklin2,3

  • 1NIHR Health Protection Research Unit in Respiratory Infections, National Heart and Lung Institute, Imperial College London, London W21PG, United Kingdom.

Genome research
|October 15, 2024
PubMed
概括

分裂k-mer分析 (SKA2) 提供快速,准确的细菌基因型识别,没有参考偏差. 这种开源工具增强了公共卫生基因组分析,包括疫情调查和传播重建.