在PDGF-BB治疗骨髓衍生中介细胞干细胞后,动态染色质可访问性和转录组变化
Sheng Liu1, Xiaona Chu1, Jill L Reiter1
1Department of Medical and Molecular Genetics, Indiana University School of Medicine, Indianapolis, IN, 46202, USA.
BMC genomics
|October 15, 2024
概括
血小板衍生生长因子 (PDGF) -BB通过改变染色质可访问性来增强介质干细胞 (MSC) 的增殖和分化. 捐赠者变异影响分化,PDGF-BB可能通过外体促进细胞间通信.
科学领域:
- 干细胞生物学 干细胞生物学
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 介酶干细胞 (MSC) 是具有治疗潜力的多能细胞,但面临着低移植等挑战.
- 血小板衍生生长因子 (PDGF) -BB正在研究,以提高MSC的治疗疗效.
- 了解PDGF-BB对MSC基因表达和染色体的影响至关重要.
研究的目的:
- 研究PDGF-BB对人类初级MSCs的基因表达特征的影响.
- 分析PDGF-BB对MSCs染色质可访问性景观的影响.
- 阐明了PDGF-BB介导的MSC调制背后的分子机制.
主要方法:
- 对人类初级MSCs进行了RNA测序,有或没有PDGF-BB刺激.
- 进行了染色素可访问性分析,以评估监管区域的变化.
- 采用了转录和表观基因组数据的综合分析.
主要成果:
- PDGF-BB治疗改变了染色质可访问性格局,影响了基因激活和抑制.
- 观察到AP-1转录因子家族成员 (TEAD,CEBP,RUNX2) 的变化.
- PDGF-BB促进了MSC的扩散和分化成骨质母细胞,脂肪细胞和肌细胞,具有依赖于捐赠者的变异.
结论:
- 通过AP-1转录因子,PDGF-BB诱导MSC的增殖和分化.
- 捐赠者特定的差异显著影响MSC差异化程度.
- 对外体相关基因的丰富表明PDGF-BB在细胞间通信中的作用.
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