结直肠癌中的过度表达与CARD11相关的转录组剖析意味着瘤免疫微环境和癌症途径通过NF-κBB调节的潜在作用
Faisal Alhosani1,2,3,4, Burcu Yener Ilce1, Reem Sami Alhamidi1
1Research Institute of Medical and Health Sciences, University of Sharjah, Sharjah P.O. Box 27272, United Arab Emirates.
International journal of molecular sciences
|October 16, 2024
概括
过度表达CARD11通过促进细胞生长,组织重塑和免疫反应,使结肠直肠癌 (CRC) 的预后恶化. 它还通过诸如化疗和细胞外矩阵组织等途径增强CRC的侵入性.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 在瘤学瘤学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- 核因子-κB (NF-κB) 途径对炎症和免疫力至关重要,其失调与癌症等疾病有关.
- CARD11是BCL10-MALT1复合体中的一个关键信号分子,位于NF-κB通路的下游.
- 了解CARD11的作用对于阐明结直肠癌 (CRC) 进展至关重要.
研究的目的:
- 研究CARD11过度表达如何加剧结直肠癌 (CRC) 的预后.
- 在CRC中识别受CARD11影响的细胞通路.
- 在细胞系和患者样本中分析CARD11表达水平和CRC进展之间的相关性.
主要方法:
- 对CARD11过度表达的CRC细胞系 (HCT-116,HT-29) 与对照细胞系的转录组分析.
- 对CRC患者样本 (腺瘤和癌瘤) 的比较转录组分析, CARD11表达水平不同 (低高).
- 生物信息学分析,包括绝对基因组丰富分析 (absGSEA),以确定关键的基因和途径.
主要成果:
- 细胞系中的CARD11过度表达促进了细胞生长,组织重塑和免疫反应,以及参与化疗和细胞外矩阵组织的途径,表明CRC侵入性增加.
- 关键的共同表达基因如EP300,KDM5A,HIF1A,NFKBIZ和DUSP1调解CARD11对生长和重塑的影响.
- 在患者样本中,高的CARD11表达与腺瘤中免疫微环境基因的增加以及癌症相关基因 (MAPK8IP2,EMB,EPHB6,CPEB4) 在癌症中显著上调相关.
结论:
- CARD11在结直肠癌的进展中起着重要作用,影响细胞生长,组织重塑,免疫反应和侵入性.
- 通过CARD11过度表达激活的特定基因和通路有助于过渡到更具侵略性的癌症阶段.
- CARD11表达水平是结直肠癌的潜在预后标志物.
