下一代表观遗传口腔时钟CheekAge可以预测人类血液中的死亡率
Maxim N Shokhirev1, Daniel J Kramer1, Janie Corley2
1Tally Health, New York, NY, United States.
Frontiers in aging
|October 16, 2024
概括
在口腔细胞上训练的CheekAge表观遗传钟,准确地预测血液样本中的死亡风险. 这一下一代时钟的性能优于旧型号,并识别了与寿命相关的关键DNA甲基化位点.
科学领域:
- 表观遗传学和衰老研究.
- 衰老的生物标志物
- 预测死亡率的预测.
背景情况:
- 第一代表观遗传钟估计了时间的年龄.
- 下一代时钟整合了与健康和结果相关的DNA甲基化数据.
- 一个新的口腔训练时钟 (CheekAge) 曾经开发过,但没有得到死亡率的验证.
研究的目的:
- 评估CheekAge表观遗传钟预测死亡率的能力.
- 将CheekAge的性能与第一代钟表和其他下一代钟表进行比较.
- 在CheekAge中识别关键的DNA甲基化位点,这些位点有助于血液中的死亡率预测.
主要方法:
- 将CheekAge时钟应用于来自Lothian出生队伍的纵向血液DNA甲基化数据.
- 统计分析以确定CheekAge预测与死亡风险 (危险比率) 之间的关联.
- 代移除单个CpG位点以确定关键预测因子和相关基因的丰富分析.
主要成果:
- 在血液样本中,CheekAge显著预测死亡率,每标准偏差增加1.21的危险比.
- 奇克时代表现优于所有测试的第一代时钟,表现与血液训练的下一代时钟 (DNAm PhenoAge) 相美.
- 排除cpG位点cg14386193 (注释为ALPK2) 影响死亡率的关联最为显著,增加了错误发现率.
结论:
- CheekAge表观遗传时钟是死亡风险的验证预测指标,即使它被应用到与其训练的不同组织类型 (血液) (口腔细胞) 时也是如此.
- 脸年龄代表了评估健康和死亡率的宝贵工具.
- 新型DNA甲基化位点,特别是cg14386193,被确定为死亡率预测的重要贡献者.
