通过基于分子紧技术的RT-qPCR快速检测SARS-CoV-2变种
Shuo Shen1, Andrew Y Fu1, Maidar Jamba1
1DiaCarta Inc., Pleasanton, California, USA.
Microbiology spectrum
|October 16, 2024
概括
一种新的基于异核酸的分子结试验能够快速,经济有效地检测SARS-CoV-2变种. 这种多重反转录定量实时PCR (RT-qPCR) 测试可以准确识别Delta和Omicron突变,帮助全球监测工作.
科学领域:
- 分子生物学和病毒学.
- 开发用于传染病的诊断工具.
背景情况:
- 随着SARS-CoV-2变种的出现,由于疫苗迅速传播和疫苗有效性降低,造成了挑战.
- 在全球范围内,对于检测新的和新出现的SARS-CoV-2变种而言,需要快速,经济高效的测试非常重要.
研究的目的:
- 开发一种多重反转录定量实时PCR (RT-qPCR) 试验,用于快速检测SARS-CoV-2多变体.
- 利用基于异核酸 (XNA) 的分子紧技术,提高变种检测能力.
主要方法:
- 在多重RT-qPCR试验中应用基于XNA的分子紧技术.
- 测试了649个鼻抽样样,用于临床诊断和监测.
- 特定检测与Delta (D614G,T478K,L452R) 和Omicron (K417N,T478K,N501Y,D614G) 变种相关的突变.
主要成果:
- 该测试正确识别了所有36个Delta变异样本和所有34个Omicron变异样本.
- 证明可靠检测各种SARS-CoV-2变体,分析灵敏度为100副本/毫升.
- 实现了大约4小时的周转时间,提供与下一代测序 (NGS) 试验相比或更好的高灵敏度.
结论:
- 基于XNA的新型RT-qPCR测定是一种快速,可靠和具有成本效益的工具,用于大规模检测SARS-CoV-2变种.
- 该平台可以被临床实验室用于常规SARS-CoV-2测试,为基于NGS的方法提供替代方案.
- 该试验具有可扩展性,并且可以轻松适应用于检测未来新出现的SARS-CoV-2变种.
