使用聚合酶链反应 (PCR) 设计通用原料混合物探测和量化抗生素耐药基因的指导方针

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 分子生物学分子生物学
• 遗传学 是一个遗传学.

背景情况:

• 生物膜中的多药耐药排泄 (MDREPs) 带来了重大的临床挑战.
• 目前的PCR检测方法需要精确的初始设计,以避免诊断错误.
• 万能原始剂对核心基因有效,但对MDREPs等辅助基因是不有效的.

研究的目的:

• 为设计针对MDREP基因的原始剂制定指导方针.
• 为了优化使用*in silico*多个序列对齐来创建原料.
• 开发和测试*sugE*基因的原料,编码一个小的多药耐药性 (SMR) 蛋白质.

主要方法:

• 使用*in silico*多个序列对齐来识别用于初始准的保留区域.
• 制定了一个用于从*in silico*到*in vitro*验证的初级设计指南.
• 与合成DNA和生物提取的DNA生成和测试原料.

主要成果:

• 成功设计了向*sugE*基因的原料.
• 原始检测显示合成DNA序列的结果是正确的.
• 原料的性能与从目标生物体中提取的DNA不一致,这表明了局限性.

结论:

• 通过PCR准确检测MDREP,初级设计准则是必不可少的.
• 由于基因组的变异性,对MDREPs等辅助基因的表征仍然存在挑战.
• 为了可靠地*in vitro*应用设计的原料,还需要进一步的优化.