基于CD4+常规T细胞基因的机器学习模型,用于预测结直肠癌的存活率和免疫反应
Zijing Wang1, Zhanyuan Sun1, Hengyi Lv1
1First Clinical Medical College, General Hospital of Ningxia Medical University, 804 Shengli Road, Yinchuan, 750004, China.
Scientific reports
|October 18, 2024
概括
使用基于八个CD4+T细胞基因 (CD4TGs) 的新风险评分 (RS) 改善了结肠直肠癌 (CRC) 生存预测. 该模型准确预测患者的预后,并与恶性瘤相关联,有助于治疗策略.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 大肠直肠癌 (CRC) 是导致死亡的主要原因,预计到2040年发病率将增加.
- CD4+常规T细胞 (CD4Tconv) 对于抗癌免疫反应至关重要,但它们在CRC中的预后作用尚未研究.
研究的目的:
- 开发和验证基于CD4+T细胞相关基因 (CD4TGs) 的结直肠癌 (CRC) 新型预后风险评估模型.
- 评估模型的预测准确性及其与瘤微环境 (TME) 的相关性以及潜在的治疗影响.
主要方法:
- 分析了来自TCGA和GEO数据库的转录和临床数据.
- 确定了CD4TG,并使用单变Cox回归选择了预后基因.
- 使用101个机器学习算法构建了一个风险分数 (RS) 模型,并通过生存分析,ROC曲线,名录和校准图表进行验证.
- 基因组丰富分析 (GSEA) 探索了基因功能和TME的影响.
主要成果:
- 开发了一种包含8个CD4TG的新型预后模型,证明了与CRC患者结果的显著联系.
- 衍生的RS在预测整体存活率方面显示出高可靠性,并且与CRC恶性病变相关.
- 较高的RS与TME内的免疫细胞透和免疫基因活性增加有关.
结论:
- 开发的基于CD4TG的风险模型为CRC风险评估提供了新的生物标志物.
- 该RS作为CRC患者的独立预后指标.
- 该模型有可能通过综合治疗方法来增强治疗策略并改善CRC的临床结果.
