构建具有竞争力的内源RNA网络,并确定血管化中的潜在调节轴
Tongxin Xu1, Yuzhe Li2,3,4, Meijuan Cheng2,3,4
1Department of CT&MRI, The Fourth Hospital of Hebei Medical University, Shijiazhuang, P.R. China.
概括
这项研究揭示了lncRNA Prrc2c通过调节miR-145-5p/Smad3通路,促进慢性病中的血管化. 这一发现为诊断和治疗血管化提供了一个新的目标.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 遗传学 遗传学 是一个
- 生物化学 生物化学
背景情况:
- 血管化 (VC) 是慢性病 (CKD) 进展的标志.
- 竞争性内源性RNA (ceRNA) 网络在VC中的作用仍未得到充分研究.
- 在VC中识别新的调节机制对于治疗开发至关重要.
研究的目的:
- 在高酸盐条件下,在血管光滑肌细胞 (VSMC) 中构建和分析ceRNA网络.
- 确定涉及风险投资的关键监管途径.
- 验证已识别的ceRNA组件在促进VSMC化中的作用.
主要方法:
- 用β-糖酸盐 (β-GP) 处理的VSMC的转录组测序.
- 生物信息分析包括基因本体学 (GO),KEGG通路和蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 网络构建.
- 使用多个miRNA数据库建立ceRNA网络.
- 实验验证使用qRT-PCR,Western blot和双露西法酶记者测定.
主要成果:
- 鉴定了647种不同表达的lncRNA和289种不同表达的mRNA.
- 丰富分析揭示了与骨质细胞分化的负调节相关的途径.
- 构建了一个具有107个相互作用对的ceRNA网络,突出显示了lncRNA Prrc2c/miR-145-5p/Smad3轴.
- 在体外实验证实了lncRNA Prrc2c通过这个轴促进VSMC化.
结论:
- 这项研究阐明了高酸盐诱导的VSMC化中的新型ceRNA网络.
- lncRNA Prrc2c通过miR-145-5p/Smad3通路作为VSMC化的主要促进者.
- 这个轴代表了在CKD中血管化的潜在诊断和治疗目标.


