坎皮洛巴克特菌的多样性spp. 在 rhesus macaque (Macaca mulatta) 繁殖殖社中循环使用培养和分子方法

科学领域:

• 兽医微生物学 兽医微生物学
• 灵长类传染性疾病.
• 胃肠病学 胃肠病学

背景情况:

• 胃肠道疾病在非人类灵长类殖民地很常见,导致住院和安乐死.
• 坎比洛巴克特菌种在 rhesus macaques (RM) 中引起急性肠球炎,并可能导致慢性肠球炎 (CE),类似于人类的后感染性易怒肠综合征.
• 有限的研究描述了RM殖民地Campylobacter的特征,特别是使用全基因组测序 (WGS) 并与宿主健康相关.

研究的目的:

• 在RM繁殖殖民地中对坎皮洛巴克特物种进行表征.
• 为了比较通过qPCR检测到的C. jejuni和C. coli的流行率与培养.
• 在RM中识别坎皮洛巴克特存在和肠道疾病的风险因素.

主要方法:

• 培养,定量PCR (qPCR) 和全基因组测序 (WGS) 用于分析来自RM的275个样本.
• 评估了患病率,抗微生物耐药性和毒性基因 (细胞致死性扩散毒素).
• 确定了坎比洛巴克特菌存在和肠道疾病的危险因素.

主要成果:

• 培养物发现了大肠杆菌和大肠杆菌,在一些分离物中具有显著的类和类耐药性,特别是在患病动物中.
• 在WGS中,发现了一种多样化的Campylobacter spp.种群. 具有预测的阻力模式.
• 与培养相比,qPCR检测到C. coli (45.9%) 和C. jejuni (29.6%) 的流行率较高.
• 在肠道疾病的动物中,坎皮洛巴克特的数量更高,年轻年龄与感染和疾病有关.
• qPCR检测到明显更多的C. jejuni阳性动物比培养.

结论:

• 这项研究提供了对Campylobacter spp.的全面描述. 在美国的RM繁殖殖民地.
• qPCR是一种比培养更敏感的方法,用于检测RM中的C. jejuni.
• 了解坎皮洛巴克特的流行率和特征可以改善临床监测和治疗策略,以改善RM的胃肠道疾病.