对贝戈莫病毒外和与复制相关的蛋白质的植物地理分析
Alvin Crespo-Bellido1, J Steen Hoyer1, Yeissette Burgos-Amengual1,2
1Department of Ecology, Evolution and Natural Resources, School of Environmental and Biological Sciences, Rutgers, the State University of New Jersey, New Brunswick, NJ, USA.
贝戈莫病毒是重要的植物病原体,根据外衣和复制蛋白质保持广泛的地理分组 (AAEO和美洲). 甜病毒形成一个独特的类,挑战传统的分类.
科学领域:
- 植物病毒学 植物病毒学
- 分子进化是分子进化的过程.
- 人类遗传学 是一个学科.
背景情况:
- 贝戈莫病毒是主要的植物病原体,在全球造成重大作物损失.
- 传统上分为非洲,亚洲,欧洲,大洋洲 (AAEO) 和美洲群体,基于地理和基因组类型 (单片式与双片式).
- 最近基于序列的发现使已知贝戈病毒物种的数量翻了一番,需要重新评估分类.
研究的目的:
- 重新评估已经确立的贝戈莫病毒的种类地理分组.
- 用保存的病毒蛋白来研究进化关系.
- 评估最近物种扩张对分类的影响.
主要方法:
- 使用外衣蛋白 (CP) 和复制相关蛋白 (Rep) 序列进行了基因分析.
- 包括来自AAEO和美洲地区的物种代表.
- 遗传树是为了推断进化关系而构建的.
主要成果:
- 遗传学分析在很大程度上支持广泛的AAEO和美洲贝戈莫病毒分类.
- 感染甜的贝戈莫病毒形成了一个独特的,基于外套蛋白质的良好支持的类,无论其地理来源如何.
- 基因组组织 (单组/双组) 和V2/AV2基因的存在/缺失与主要的地理分布相关.
- 在AAEO和美洲集团之间发生了显著的重组,但很少发生.
结论:
- 目前的家族遗传数据支持广泛的地理分组,但突出了诸如甜贝戈莫病毒等例外情况.
- 缺少V2/AV2基因是一个关键的特征,可以区分美洲的贝戈病毒.
- 在未来,再组合和全球化可能会越来越多地模糊传统的begomovirus原生地理边界.
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