探索Calonectria spp. 的遗传基础 树的耐药性 在树中

科学领域:

• 植物遗传学和育种方法
• 林业和林业产品 林业和林业产品
• 植物病理学 植物病理学

背景情况:

• 人工杂交对于开发具有抗病能力的树品种至关重要,特别是对有害的 Calonectria spp.
• 对于成功的繁殖计划来说,了解树中抗病异构的基因机制至关重要.
• 树叶病,由Calonectria*分离物引起,对种植园构成重大威胁.

研究的目的:

• 阐明白树杂交品种对疾病耐药性的遗传基础.
• 为了确定关键的基因和途径参与抗 * Calonectria * 叶病.
• 为了比较敏感和耐药的树杂交物及其父母之间的基因表达和突变概况.

主要方法:

• 对欧卡利普特杂交的选 (易受EC333感染,耐EC338) 针对*Calonectria*隔离物.
• 混合体和父系的RNA-Seq分析以确定差异表达基因 (DEGs).
• 基因组丰富分析 (GSEA) 使用GO和KEGG注释,替代拼接分析,SNP分析和权重基因同表达网络分析 (WGCNA).

主要成果:

• 在EC333和EC338之间确定了3912个DEG,其中1631个是上调的,2281个是下调的.
• 差异表达的途径包括碳水化合物结合,六烯和三烯生物合成.
• 观察到与耐药性相关的替代拼接事件,SNP配置文件和WGCNA识别模块 (例如,MEsaddlebrown) 中存在显著差异.

结论:

• 有差异表达的基因,特别是那些参与碳水化合物结合和二次代谢物生物合成的基因,可能与Calonectria耐药性有关.
• 替代拼接和高影响性突变有助于基因变异的基础疾病耐药性.
• 这项研究为了解白树叶抗虫病的遗传基础和未来基因发现提供了基础.