动物微生物组数据是歪曲的和不公平的,破坏了它们对可持续生产改进的有用性

科学领域:

• 微生物组研究的研究.
• 动物科学动物科学
• 农业的可持续性 农业的可持续性

背景情况:

• 再动物微生物组对于动物健康,料效率和环境影响至关重要.
• 了解微生物组的组成是改善肉/牛奶生产和减少环境足迹的关键.
• 目前的研究缺乏跨动物物种,地理位置和身体部位的代表性.

研究的目的:

• 评估养殖反动物微生物组研究的全球代表性.
• 在现有研究中确定代表性不足的反动物物种,地理区域和身体部位.
• 突出阻碍开发基于微生物组的可持续性战略的数据差距.

主要方法:

• 分析了来自47628个养殖反动物微生物组样本的元数据.
• 通过国家生物技术信息中心 (NCBI) 数据库访问数据.
• 根据反动物物种,地理位置,体位和宿主特征的总结信息.

主要成果:

• 牛 (超过三分之二) 主导样本;山羊显著不足 (<4%).
• 研究集中在西欧,北美,澳大利亚和中国;南美,非洲和亚洲部分地区的代表性不足.
• 胃肠道微生物组是最受研究的 (87%),尽管其他地点在过去十年中增加了研究.
• 超过40%的样本缺乏必要的元数据 (年龄,品种,性别),限制了数据的重用性.

结论:

• 在反动物微生物组研究中存在显著的全球不平衡,某些物种和地区的代表性不足.
• 不完整的元数据阻碍了数据分析和开发用于可持续畜牧生产的微生物群信息化解决方案.
• 通过标准化元数据,鼓励对代表性不足的反动物和地区进行研究,对于推进可持续农业至关重要.