多组学分析确定了慢性阻塞性肺部疾病的药物重定位目标
1Department of Pharmaceutical Sciences, Temple University School of Pharmacy, Philadelphia, PA 19140, USA.
这项研究开发了一个计算管道,以确定慢性阻塞性肺病 (COPD) 的新治疗点. 该研究确定了92个COPD特征基因,其中70个是新型COPD治疗的可用药物标.
科学领域:
- 系统生物学 系统生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
- 代谢学 代谢学 代谢学
- 药物基因组学 药物基因组学
背景情况:
- 慢性阻塞性肺病 (COPD) 研究已取得进展,但使用综合多omics数据系统识别治疗点仍然有限.
- 需要新的COPD治疗策略,需要通过先进的计算方法发现新的药物标.
研究的目的:
- 开发一个系统生物学管道,以确定生物相关的基因和COPD的潜在治疗点.
- 通过药物重新定位或新的药物发现来促进新型COPD治疗方法的发现.
主要方法:
- 整合了来自超过50万个人类样本的多奥米克COPD数据 (基因组,转录组,蛋白质组,代谢组).
- 使用基于距离的网络计算模型对互动组和药物向信息进行in silico分析.
- 基因候选人的排名基于所有奥米克级别的签名基因的近距离.
主要成果:
- 鉴定了92个COPD特征基因,这些基因参与了细胞外矩阵结构成分,原结合和蛋白酶结合等功能.
- 在已识别的特征基因中确定了70个可用药物的标.
- 在体验证表明,特定的基因 (例如,SPP1,APOA1,CTSD) 可以调节与COPD相关的细胞转录组.
结论:
- 该研究通过一个产生假设的管道成功确定了COPD有希望的治疗点.
- 确定了包括已知和新型基因在内的目标,为开发新的COPD疗法提供了潜力.
- 该管道利用无偏见的OMIC数据,疾病相关性和开发可行性来进行可靠的目标识别.
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