在Solanaceae中对APETALA2 / 乙烯响应因子转录因子的基因组学分析和功能特征
Fan Yang1, Songxue Han1, Yangxin Zhang1
1College of Horticulture, Northwest A&F University, Yangling 712100, China.
International journal of molecular sciences
|October 26, 2024
概括
在Solanaceae植物中,AP2/ERF基因家族通过全基因组和并联重复扩大. 这些转录因子的功能多样化,增强了植物的适应能力,调节了开花时间.
科学领域:
- 植物基因组学 植物基因组学
- 分子生物学分子生物学
- 进化生物学是进化的生物学.
背景情况:
- AP2/ERF家族是一大群转录因子,对植物生长,发育和应激反应至关重要.
- 由于复杂的基因组重复事件,了解Solanaceae中的AP2/ERF进化是有限的.
研究的目的:
- 在Solanaceae中识别和描述AP2/ERF基因.
- 调查全基因组复制 (WGD) 和双重复制在AP2/ERF基因放大和多样化中的作用.
- 探索Solanaceae中AP2/ERF基因的功能分歧.
主要方法:
- 在7种Solanaceae物种中对AP2/ERF蛋白的全基因组识别.
- 对基因重复事件的分析 (WGDs和合重复).
- 合成分析用于研究基因分布模式.
- 基因表达分析和功能测试 (基因沉默,过度表达).
主要成果:
- 在7个Solanaceae基因组中确定了1282个AP2/ERF蛋白.
- 无论是WGD还是合重复,都对AP2/ERF基因放大有显著的贡献.
- 合成分析证实了WGD对AP2/ERF基因分布的影响.
- 不同的表达模式表明重复的AP2/ERF基因的功能分歧.
- 发现ERF-1成员可以调节C.annuum的花发育时间.
结论:
- 在Solanaceae中AP2/ERF基因扩张归因于WGD和并联重复.
- 重复的AP2/ERF基因进化了不同的功能,增强了Solanaceae的适应性.
- 这项研究提供了对Solanaceae AP2 / ERF转录因子的起源,重复和功能分歧的基因组见解.
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