与无处不在的双斑蜘蛛,Tetranychus urticae相关的病毒组的表征

科学领域:

• 农业昆虫学 农业昆虫学
• 病毒学 病毒学
• 生物信息学是一种生物信息学.

背景情况:

• 像虫这样的农业害虫,特别是Tetranychidae家族的成员,会造成大量的作物损害和损失.
• 双斑蜘蛛,Tetranychus urticae是一个臭名昭著的害虫,影响全球众多植物物种.
• T. urticae 的病毒组在很大程度上是未知的,这对植物病原体的传播和粮食安全构成风险.

研究的目的:

• 为了描述农业害虫Tetranychus urticae的病毒组.
• 识别与T. urticae相关的新型病毒和病毒菌株.
• 评估T. urticae作为感染植物病毒的载体的潜力.

主要方法:

• 利用来自不同地理和采样条件的公开可用的RNA深度测序库 (共30个).
• 采用集成的de novo病毒发现生物信息管道进行序列分析.
• 进行了遗传学分析,以分类已识别的病毒序列.

主要成果:

• 确定了与T. urticae相关的20个病毒序列.
• 发现了11个新的病毒序列,其中8个被分类为已知的病毒家族 (Nodaviridae,Kitaviridae,Phenuiviridae,Rhabdoviridae,Birnaviridae,Qinviridae) 和3个在顺序层面 (Picornavirales,Reovirales).
• 发现了9个代表已知的病毒新菌株的序列,包括豆类常见马赛克病毒 (BCMV) 和Phaseolus vulgaris alphaendornavirus 1.

结论:

• 这项研究扩展了虫害虫T. urticae. 的已知病毒组.
• 突出了T. urticae在传播重要的植物病原体方面的潜在作用.
• 强调需要持续进行病毒监测,以应对新出现的农业威胁.