确定双重rtPCR监测测试样本组合的诊断敏感性损失极限:东方和边缘

科学领域:

• 兽医医学 兽医医学 兽医医学
• 分子诊断学 分子诊断
• 流行病学 流行病学

背景情况:

• 由Theileria orientalis和Anaplasma marginale引起的牛贫血对畜牧业构成重大威胁.
• 扩大监测测试能力对于有效的疾病管理和控制至关重要.
• 样本聚合是一种增加测试吞吐量的策略,但其对测试灵敏度的影响需要彻底评估.

研究的目的:

• 开发和验证一个框架来评估从聚合的样本稀释对rtPCR测定灵敏性的影响.
• 确定用于对T. orientalis和A. marginale.进行监测的最大可接受的样本池大小.

主要方法:

• 验证了一个使用双重rtPCR用于T. orientalis和A. marginal监测的框架.
• 测试了个别阳性样本和2,4,6,8和10个样本的池.
• 将单个样本的Ct值与聚合样本进行比较,以评估敏感性损失和Ct增加.

主要成果:

• 观察到T. orientalis和A. marginal在所有池子大小中的最大敏感性损失为2%.
• 在聚合样本中报告了低于预期的平均Ct增加和敏感性损失.
• 证明将最多10个样本组合为区域监测是可以接受的.

结论:

• 最多10个样本的样本组合是T. orientalis和A. marginal使用rtPCR进行监测的可行策略.
• 经过验证的框架可以应用于各种rtPCR分析,以评估聚合策略.
• 这种方法可以显著提高疾病监测计划的效率和能力.