机器学习可以提高人们对狂犬病流行病学在低监控环境中的理解
Ravikiran Keshavamurthy1, Cassandra Boutelle2, Yoshinori Nakazawa2
1Poxvirus and Rabies Branch, Division of High Consequence Pathogens and Pathology, National Center for Emerging and Zoonotic Infectious Diseases, Centers for Disease Control and Prevention, Atlanta, GA, USA. mfl3@cdc.gov.
Scientific reports
|October 29, 2024
概括
机器学习,特别是过量采样的极端梯度增强 (XGB),可以准确地预测动物的狂犬病. 这有助于改善在资源有限的环境中对动物传播疾病的监测.
科学领域:
- 兽医流行病学 兽医流行病学
- 动物传染病监测监测动物传染病.
- 机器学习在公共卫生中的应用.
背景情况:
- 低收入和中等收入国家的狂犬病调查往往缺乏确的诊断.
- 流行病学解释严重依赖临床数据,限制了准确性.
- 综合咬伤病例管理 (IBCM) 计划需要改进诊断支持.
研究的目的:
- 为了比较狂犬病概率估计的极端梯度增强 (XGB) 和物流回归 (LR).
- 为动物狂犬病病例制定风险分层框架.
- 通过在资源有限的环境中使用机器学习来增强动物传染病监测.
主要方法:
- 采用XGB和LR模型来预测研究动物的狂犬病概率.
- 利用随机过量抽样 (ROS) 和合成少数过量抽样技术进行数据平衡.
- 开发了一个基于预测狂犬病概率的风险分层框架.
主要成果:
- 与LR相比,XGB在预测狂犬病病例方面表现优越.
- 过量采样技术显著提高了对动物狂犬病等罕见事件的模型灵敏度.
- XGB-ROS有效地分类了高风险病例 (85.2%确诊的狂犬病) 和中等风险病例 (8.4%确诊的狂犬病).
- 基于模型的风险分层比常规IBCM增加了3.2倍的流行病学有用数据.
结论:
- 机器学习,特别是过量采样的XGB,为准确的狂犬病预测提供了强大的解决方案.
- 这种方法加强了在资源有限的环境中对动物传播疾病的监测.
- 使用ML进行风险分层增强了动物研究数据的有用性.


