定义血液样本转录基因分析的最佳设置,以预测免疫治疗NSCLC患者的反应

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 免疫学 免疫学 免疫学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 在非小细胞肺癌 (NSCLC) 中预测对免疫检查点抑制剂 (ICI) 的反应对于患者管理至关重要.
• 用于生物标志物检测的组织活检是侵入性的,容易产生采样偏差.
• 基于血液的非侵入性转录基因分析提供了一个有前途的替代方案.

研究的目的:

• 探索最佳的分析方法来识别NSCLC中ICI反应的系统生物标志物.
• 使用血液样本比较不同的转录组分析方法 (差异表达,ssGSEA,细胞类型解卷) .
• 评估这些方法在预测治疗反应方面的表现.

主要方法:

• 在治疗前和响应评估时,从33名ICI治疗的NSCLC患者收集了外周血液单核细胞和全血 (WB).
• 进行了大量的多基化RNA测序.
• 分析了基因表达特征,使用差异表达,ssGSEA和细胞类型解卷.
• 使用ROC曲线分析和后勤回归来评估预测性能.

主要成果:

• 治疗后全血 (WB) 基因表达和细胞类型解显示出高预测精度 (AUC=0.87和0.85).
• 单个样本基因组丰富分析 (ssGSEA) 成绩显示,在所有样本类型和时间点 (AUC > 0.7) 中,分类性能优越.
• ssGSEA成为预测临床益处的最有效的非侵入性生物标志物.

结论:

• 通过ssGSEA进行的转录组分析是一种高效的非侵入性生物标志物,用于预测NSCLC患者的ICI治疗反应.
• 治疗后的WB基因表达和解也显示出预测临床益处的前景.
• 基于血液的转录组定型为预测ICI反应提供了侵入性组织活检的可行替代方案.