生物信息学 鉴定和验证与血管新生相关的基因在心肌缺血性再输液损伤中的血管新生相关的基因

科学领域:

• 心血管生物学 心血管生物学
• 分子医学是分子医学.
• 生物信息学是一种生物信息学.

背景情况:

• 血管新生对于心肌缺血-反损伤 (MIRI) 恢复至关重要.
• 针对MIRI中的血管生成的现有治疗策略有限.
• 需要生物信息学方法来识别MIRI干预的关键基因.

研究的目的:

• 在MIRI中使用生物信息学识别关键血管生成相关基因 (ARG).
• 探索MIRI中发现的基因的诊断和治疗潜力.

主要方法:

• 分析了两个小鼠心脏I / R表达数据集 (GSE61592,GSE83472) 以找到差异表达基因 (DEG).
• 与ARG集成的DEG用于识别差异表达的ARG (ARDEG).
• 在体外MIRI模型中利用了权重基因相关性网络分析 (WGCNA),蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 网络和受体操作特征 (ROC) 曲线用于基因识别和验证.

主要成果:

• 在MIRI中鉴定出47个不同表达的血管生成相关基因 (ARDEGs).
• 确定了四个枢纽基因:细胞因子信号传递3 (Socs3) 抑制剂,C-X-C 动因化学因子连接物1 (Cxcl1),介质素1β (Il1b) 和矩阵金属酶9 (Mmp9).
• Socs3,Cxcl1,Il1b和Mmp9表明MIRI具有显著的诊断潜力,体外验证证证实了表达模式.

结论:

• Socs3,Cxcl1,Il1b和Mmp9在MIRI病原和免疫细胞透中发挥着至关重要的作用.
• 这些基因对MIRI具有很强的诊断准确性.
• 这些已识别的基因代表了未来MIRI诊断和治疗策略的有希望的分子标.