SMaRT M-Seq:在单克隆性乳腺病变中进行M蛋白序列测序的优化逐步协议
Alice Nevone1,2, Francesca Lattarulo1,2, Monica Russo1,2
1Department of Molecular Medicine, University of Pavia, Pavia, 27100, Italy.
Biology methods & protocols
|October 30, 2024
概括
一种新的方法,单分子实时测序M蛋白 (SMaRT M-Seq),有效地测序M蛋白. 这一进步有助于个性化医疗和单克隆性牙病的机械学研究.
科学领域:
- 生物化学 生物化学
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 遗传学 遗传学是一种遗传学.
背景情况:
- 在单克隆性血红细胞病变中,来自B细胞/血细胞的单克隆抗体 (M蛋白) 是生物标志物,可以导致器官损伤.
- 目前的M蛋白测序方法昂贵,耗时,并且在范围和验证方面存在局限性.
- 现有的下一代测序和质谱方法可能需要瘤细胞分类,并且仅限于特定的免疫球蛋白基因或患者子集.
研究的目的:
- 提出一种用于测序M蛋白的新型,验证的协议.
- 克服现有的M蛋白测序技术的局限性.
- 为了促进个性化医疗和单克隆性牙病的机械学研究.
主要方法:
- 开发了M蛋白单分子实时测序 (SMaRT M-Seq).
- 通过循环化cDNA的逆PCR将表达的免疫球蛋白基因的无偏放大结合在一起.
- 使用长期读取的DNA测序,然后进行生物信息和免疫遗传分析.
主要成果:
- 通过SMaRT M-Seq,可以明确识别全长的M蛋白变量序列.
- 该方法在各种患者队列中有效,包括那些瘤负担较低的患者.
- 该协议已在技术上得到验证,并应用于大型患者队列.
结论:
- SMaRT M-Seq为并行M蛋白质测序提供了一种具有成本效益和时间效率的解决方案.
- 这种方法提高了对患者特定M蛋白序列的获取.
- 促进了个性化医疗和对单克隆性乳腺病变的更深层次的机械洞察力.
