gutMGene v2.0:一个针对肠道微生物和微生物代谢物的基因的更新综合数据库
Changlu Qi1, Guoyou He1, Kai Qian1
1College of Bioinformatics Science and Technology, Harbin Medical University, Harbin, Heilongjiang 150081, China.
Nucleic acids research
|October 30, 2024
概括
肠道微生物群通过代谢物影响宿主健康. 更新的gutMGene数据库 (v2.0) 现在将肠道微生物,它们的代谢物和宿主基因联系起来,有助于平衡研究.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 代谢学 代谢学 代谢学
背景情况:
- 肠道微生物群在宿主生理学中起着至关重要的作用,主要由微生物代谢产物介导.
- 了解肠道微生物,它们的代谢物和宿主基因之间的复杂关系对于破译宿主平衡至关重要.
- gutMGene数据库最初是为了支持这一研究领域而启动的.
研究的目的:
- 更新和增强肠道MGene数据库,增加有关肠道微生物-代谢物-宿主基因相互作用的新发现.
- 为研究肠道微生物群对宿主健康的作用的研究人员提供全面和可访问的资源.
- 改进功能和用户界面,以便更轻松地进行数据探索.
主要方法:
- 进行了广泛的文献审查,以提取和分类肠道微生物,代谢物和宿主基因之间的关联 (因果/相关性).
- 对代表性人类和小鼠肠道微生物基因组进行了代谢重建.
- 升级了Web界面,以提高可访问性和功能.
主要成果:
- 纳入了关于肠道微生物-代谢物-宿主基因关联的新数据,将它们分类为因果或相关的.
- 添加了关键肠道微生物物种的代谢重建.
- 推出了gutMGene v2.0与增强的Web界面,改善用户体验和数据检索.
结论:
- 更新的gutMGene v2.0数据库为研究肠道微生物群对宿主恒温的贡献提供了显著增强的资源.
- 该数据库通过提供有关微生物代谢物及其与宿主基因的联系的精选信息来促进研究.
- 预计gutMGene v2.0将加速肠道微生物组研究的发现及其对宿主健康的影响.
