组织幻灯片上单个细胞和器官的空间蛋白质组学,使用过器辅助扩张蛋白质组学
Zhen Dong1,2,3, Wenhao Jiang1,2,3, Chunlong Wu1,2,3
1School of Medicine, Westlake University, Hangzhou, Zhejiang Province, China.
Nature communications
|October 31, 2024
概括
过辅助扩展蛋白质组 (FAXP) 增强了用于甲固定抛嵌入 (FFPE) 组织的空间蛋白质组. 这种新的方法提高了分辨率,产量和蛋白质识别,同时减少了准备时间.
科学领域:
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
- 生物技术是生物技术.
- 分析化学 分析化学
背景情况:
- 使用基于水凝的组织扩张的空间蛋白质学是一个新兴的领域.
- 对已存档的甲固定嵌体 (FFPE) 标本的分析提出了独特的挑战.
- 像ProteomEx这样的先前方法为空间蛋白质组学提供了基础.
研究的目的:
- 引入一种新的过辅助扩展蛋白学 (FAXP) 策略.
- 为了增强FFPE标本的空间蛋白质组学分析.
- 改进现有的组织扩张和质谱 (MS) 工作流程.
主要方法:
- 开发一个过辅助扩展蛋白学 (FAXP) 战略.
- 使用定制的尖端设备,以提高样品准备的稳定性和吞吐量.
- 集成的FAXP与激光捕捉微解剖用于图像引导分析.
主要成果:
- 实现了体积分辨率的14.5倍增加.
- 与以前的方法相比,产生了超过8倍的产量.
- 增加了255%的蛋白质识别,并减少了50%的样本准备时间.
结论:
- FAXP为FFPE组织上的空间蛋白质学提供了一个强大的和可重复的工作流.
- 证明了FAXP在人类结直肠FFPE样本上的适用性.
- 在图像指导下首次启用真正的单子细胞蛋白质组学.
