通过整合RNA测序和单细胞RNA测序数据,确定HIF1A和HGF作为大动脉剖析和功能分析中的两个枢纽基因
Hai-Bing Li1, Chang Liu1, Xiang-Di Mao1
1Department of Physiology and Pathophysiology, State Key Laboratory of Vascular Homeostasis and Remodeling, Peking University School of Basic Medical Sciences, Beijing, China.
Frontiers in cardiovascular medicine
|October 31, 2024
概括
这项研究确定HIF1A和HGF是大动脉剖析 (AD) 发育中的关键基因. 这些在巨细胞和光滑肌肉细胞中发现的基因促进炎症和信号传递,为AD提供了潜在的诊断和治疗点.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 分子生物学分子生物学
- 心血管研究研究心血管研究
背景情况:
- 大动脉解剖 (AD) 是一种危及生命的疾病,其起源尚不清楚.
- 确定关键的分子参与者对于改善AD诊断和治疗至关重要.
研究的目的:
- 揭示调节机制,并确定参与大动脉剖析的枢纽基因.
- 分析已识别的枢纽基因的功能和诊断潜力.
主要方法:
- 来自公共数据库的综合RNA测序 (RNA-seq) 和单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 数据.
- 应用加权基因共同表达网络分析,差异表达分析和蛋白质-蛋白质相互作用网络构建.
- 在大动脉剖析的小鼠模型中验证了枢纽基因表达.
主要成果:
- 确定了五个主要的枢纽基因:HIF1A,HGF,HMOX1,ITGA5和ITGB3.
- 在AD患者中,HIF1A在巨细胞和HGF在血管光滑肌细胞 (SMC) 中被上调.
- HIF1A调节炎症,葡萄糖分解和血管生成; HGF调节细胞信号传递.
结论:
- HIF1A和HGF被确定为关键的枢纽基因,具有对AD的诊断潜力.
- HIF1A通过炎症和代谢变化促进AD;HGF影响AD发病的细胞通信.
