SSBD:一个生态系统,用于加强生物成像数据的共享和重复使用
Koji Kyoda1, Hiroya Itoga1, Yuki Yamagata2,3
1Laboratory for Developmental Dynamics, RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research, 2-2-3 Minatojima-minamimachi, Chuo-ku, Kobe, Hyogo 650-0047, Japan.
Nucleic acids research
|October 31, 2024
概括
更新后的科学和统计数据库 (SSBD) 现在提供了两层生物成像数据共享:一个公共存储库和一个策划数据库. 这提高了数据的可访问性,并促进了全球生态系统中的重复使用.
科学领域:
- 生物成像是一种生物成像.
- 数据科学数据科学数据科学
- 生命科学 生命科学
背景情况:
- 科学和统计数据库 (SSBD) 是一个共享和重复使用生物成像数据的平台.
- 现有平台面临的挑战是如何平衡快速数据发布与需要丰富注释,可重复使用的数据.
研究的目的:
- 通过引入双层数据资源结构来增强SSBD平台.
- 通过解决数据发布和注释的相互矛盾需求,促进生物成像数据的共享和再利用.
- 将SSBD定位为全球生物成像数据生态系统的核心组成部分.
主要方法:
- 实施了双层数据资源:SSBD:用于公开共享所有期刊报告的生物成像数据的存储库,以及SSBD:用于精选的,富含元数据数据的数据库.
- 专注于跨数据资源的元数据协调,以实现交叉搜索和数据交换.
- 将SSBD集成到创始GIDE联盟中,以促进全球图像数据生态系统.
主要成果:
- 现在SSBD是一个双资源平台,包括一个公共存储库和一个附加值数据库.
- 更新的结构有效地解决了快速数据发布和全面数据注释的需求.
- 通过将SSBD整合到foundingGIDE中,促进了国际合作和数据交换.
结论:
- 增强的SSBD平台显著改善了生物成像数据的共享和重复使用.
- 对元数据的协调对于建立连接的全球生物成像数据生态系统至关重要.
- 现在,SSBD是建立全球生物成像数据基础设施的关键参与者.
