逻辑回归和统计规范化技术用于冠状动脉疾病的风险分类,使用由高密度脂蛋白运输的细胞因子
Seema Singh Saharan1, Pankaj Nagar2, Kate Townsend Creasy3
1Department of Clinical Pharmacy, University of California, San Francisco, USA, UCSF Kane Lab, San Francisco, USA, UC Berkeley Extension, Berkeley, USA.
机器学习模型通过分析年龄和细胞因子生物标志物,准确地识别出患冠状动脉疾病 (CAD) 风险的个体. 脊柱回归实现了最高的准确性,突出了改善CAD风险评估的关键炎症标志物.
科学领域:
- 心血管医学 心血管医学
- 生物标志物和炎症的研究
- 计算生物学和机器学习
背景情况:
- 冠状动脉疾病 (CAD) 仍然是全球首要的死亡原因.
- 动脉样硬化,是CAD的根本原因,是一种涉及细胞因子的炎症过程.
- 新型生物标志物,如在高密度脂蛋白 (HDL) 上运输的细胞因子,为主动风险评估提供了潜力.
研究的目的:
- 实施机器学习算法来识别患有CAD风险的个体.
- 通过使用年龄和多维细胞因子生物标志物来评估后勤回归,LASSO和回归的有效性.
- 探索HDL相关细胞因子在血管炎症和CAD风险预测中的作用.
主要方法:
- 使用了逻辑回归和规范化技术 (LASSO,回归) 与特征选择.
- 采用k-fold交叉验证和超参数调整来优化模型.
- 使用接收器操作特征 (AUROC) 曲线下的面积来评估模型性能.
主要成果:
- 随着特征选择的回归实现了最高的AUROC得分0.878 (95% CI:0.837,0.92).
- 拉索回归产生了0.875的AUROC (95%CI:0.832,0.917),而后勤回归则达到0.85 (95%CI:0.804,0.897).
- 通过回归确定的主要生物标志物包括年龄,IL-7,RANTES,IFN-和IL-3.
结论:
- 机器学习,特别是回归,有效地使用细胞因子配置文件识别CAD风险.
- 高脂相关的细胞因子是血管炎症和CAD风险的重要指标.
- 这些发现推动了个人化医疗方法用于CAD评估和治疗.
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