EFP分析器:一个快速,准确,易于教导的程序,用于分析来自iPSC衍生的心肌细胞的细胞外场潜力
bioRxiv : the preprint server for biology
|November 1, 2024
概括
一个新的软件工具EFP-Analyzer简化了从诱导多能干细胞衍生心肌细胞 (iPSC-CMs) 测量细胞外场潜力 (EFPs). 该工具增强了iPSC-CMs用于药物发现和疾病建模的使用.
科学领域:
- 心脏病学 心脏病学
- 干细胞生物学 干细胞生物学
- 药理学 药理学是指药理学的学科.
背景情况:
- 诱导多能干细胞衍生心肌细胞 (iPSC-CMs) 对药物测试和疾病建模具有价值.
- 来自iPSC-CMs的细胞外场潜力 (EFP) 测量模仿了心电图的腹腔复合体.
- 需要专门的设备来生成EFP测量.
研究的目的:
- 开发一个用户友好,可教,可重复的软件工具来测量EFP.
- 为了创建一个半自动分析器EFP痕迹.
主要方法:
- 软件EFP-Analyzer (EFPA) 开发用于识别和平均节拍,识别地标,并计算间隔.
- 通过使用来自22个患者的iPSC-CM线 (自发跳动和光学节奏) 的358个EFP痕迹来评估EFPA.
- 应用了严格的质量标准,并测量了EFP间隔,包括场潜在持续时间 (FPD). 观察者间和观察者内部分析评估了可用性和可重复性.
主要成果:
- EFPA成功地识别和分析了EFP痕迹中的节拍,地标和间隔.
- 测量了场潜在持续时间 (FPD),光学节奏的iPSC-CM显示了比自发跳动的FPD更短的FPD (283.7±54.2比293.0±47.5毫秒,p=0.32).
- 较高的相关系数 (r:0.93-1.00) 和狭窄的布兰德-阿尔特曼共识极限表明了优秀的观察者间可重复性. EFPA准确地检测到药物诱导的 (莫西素) 和突变诱导的 (CACNA1C N639T) FPD延长.
结论:
- EFP-Analyzer (EFPA) 是一个强大的和可重复的工具,用于分析来自iPSC-CMs的EFP测量.
- EFPA促进了iPSC-CMs在药物疗效研究和疾病建模中的有效利用.
- 该软件可下载,并提供说明.
更多相关视频
08:53Human iPSC-Derived Cardiomyocyte Networks on Multiwell Micro-electrode Arrays for Recurrent Action Potential Recordings
Published on: July 15, 2019
11.5K
10:41Laser-Induced Action Potential-Like Measurements of Cardiomyocytes on Microelectrode Arrays for Increased Predictivity of Safety Pharmacology
Published on: September 13, 2022
2.0K
