线粒体小RNA变化与阿尔茨海默病小鼠模型中的溶酶体活性增加有关,由PANDORA-seq发现

科学领域:

• 分子生物学分子生物学
• 神经科学是一个神经科学.
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 小型非编码RNAs (sncRNAs),包括tRNA衍生 (tsRNAs) 和rRNA衍生 (rsRNAs),在生物过程中发挥作用.
• RNA的修改阻碍了传统的测序,导致错过了关键的sncRNAs的检测.

研究的目的:

• 开发一种方法来全面检测修饰的sncRNAs.
• 研究小鼠前额叶皮质中的sncRNA概况,特别是在阿尔茨海默病 (AD) 模型中.

主要方法:

• 开发了PANDORA-seq (通过克服RNA修饰中断测序的全景RNA显示) 来检测修饰的sncRNAs.
• 应用PANDORA-seq对小鼠前额叶皮质样本,来自AD和野生类型模型.
• 综合基因表达和sncRNA分析.

主要成果:

• 潘多拉-seq能够全面检测修饰的sncRNAs.
• 在小鼠前额叶皮层中发现了一种新型的sncRNA配置文件,该配置文件富含tsRNAs/rsRNAs.
• 与对照组相比,在AD小鼠模型中观察到线粒体tsRNAs和rsRNAs的显著下调.
• 在基因组tsRNAs和rsRNAs中没有发现类似的模式.
• 在AD中显示下调的线粒体sncRNAs和增强的溶酶体活性之间存在负相关性.

结论:

• 潘多拉-seq有效地克服了用于sncRNA测序的RNA修饰障碍.
• 线粒体tsRNA/rsRNA下调是研究的AD模型的一个特征.
• 表明线粒体RNA动态与AD病变发生过程中的 lysosomal 功能之间存在联系.
• 为进一步的机理学研究和AD治疗策略提供了基础.