在使用全基因组测序的动物性结核病Mycobacterium bovis分离物的遗传多样性和耐药性

科学领域:

• 基因组学就是基因组学.
• 微生物学 微生物学
• 公共卫生 公共卫生

背景情况:

• 由Mycobacterium bovis (M. bovis) 引起的动物性结核病 (TB) 是一个重大的全球健康问题.
• 关于人类M. bovis基因型,毒性和耐药性的信息有限.
• 全基因组测序 (WGS) 为研究这些方面提供了一个强大的工具.

研究的目的:

• 用WGS.来描述人类M. bovis的循环基因型.
• 确定与M. bovis.病毒性和耐药性相关的基因组特征.
• 了解人类M. bovis菌株的遗传关系.

主要方法:

• 来自结核病患者的涂抹阳性Ziehl-Neelsen样本进行培养.
• 从可疑的M. bovis殖民地提取DNA进行全基因组测序 (WGS).
• 使用BV-BRC和其他在线工具进行了生物信息学分析,包括家族遗传树的构建.

主要成果:

• 测序了五种M. bovis菌株,所有这些菌株都属于波利基型BOV_1;BOV_11.
• 百分之百的菌株表现出对皮拉津胺,异亚,乙胺醇,菌素和基诺具有耐药性的突变.
• 80%的菌株对利法和德拉曼尼德表现出耐药性;关键的毒性因素包括分泌系统和细胞表面组件.
• 遗传学分析显示,与来自埃及的牛菌株和来自法国,阿尔及利亚和南非的人类菌株有密切的关系.

结论:

• 人类的M. bovis分离物共享一个共同的spoligotype,但显示出多样化的遗传学模式.
• 检测到的耐药性突变跨越多种抗结核病药物,突出显示了一项重大的公共卫生挑战.
• 病毒性特征主要由分泌系统,细胞表面成分和调控系统主导.
• 遗传学联系表明,在区域范围内,牛群和人类群体之间存在潜在的传播途径.