纵向基因组学揭示了耐卡巴尼姆的Acinetobacter baumannii种群变化,随着高度耐药的ST164克隆的出现

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 基因组学就是基因组学.
• 传染性疾病 传染性疾病

背景情况:

• 耐卡巴胺的宝曼尼菌 (Acinetobacter baumannii,简称CRAB) 是一种关键的医院病原体,特别是在重症监护室 (ICU).
• 2019年之前的基因组监测确定了全球克隆2 (GC2) 是杭州重症监护室中的主导CRAB血统.

研究的目的:

• 在感染预防和控制 (IPC) 干预后,在杭州重症监护室进行CRAB的纵向基因组监测.
• 描述CRAB种群结构,抵抗机制,并识别新兴的高风险系.

主要方法:

• 在2021年,从杭州重症监护室对A. baumannii分离物进行为期三个月的纵向基因组监测.
• 全基因组测序和CRAB分离物的基因组分析.
• 与全球CRAB分离物进行比较基因组分析.

主要成果:

• 在2021年的A. baumannii分离物中,CRAB占80.9%,具有较高的碳烯耐药性.
• GC2分离物的比例从2019年的99.5%大幅下降到2021年的50.8%,显示出基因多样性的增加.
• 一个高度克隆的ST164种群 (40.2%) 出现,携带了blaNDM-1和blaOXA-23基因,并表现出更高的抗卡巴胺耐药性.

结论:

• ST164 CRAB代表了一个新兴的高风险血统,由于其独立演变的碳烯耐药性和成功传播,引起了全球的重大关注.
• CRAB种群动态的转变凸显了持续基因组监测和适应性IPC策略的需要.