高多重复合的免疫光光学PhenoCycler面板用于Murine Formalin-Fixed Paraffin-Embedded组织 提供了对瘤微环境的洞察力 免疫工程
Sachin S Surwase1, Xin Ming M Zhou2, Kathryn M Luly1
1Department of Biomedical Engineering, Johns Hopkins University, Baltimore, Maryland; Translational Tissue Engineering Center, Johns Hopkins University School of Medicine, Baltimore, Maryland; Johns Hopkins Translational ImmunoEngineering Center, Johns Hopkins University School of Medicine, Baltimore, Maryland.
我们为甲固定组织开发了一个新的空间蛋白质组学面板,使瘤免疫微环境的详细分析成为可能. 这个小组揭示了基因传递纳米粒子和抗PD1疗法如何影响黑色素瘤,为治疗疗效提供了洞察力.
科学领域:
- 空间蛋白质组学和多重免疫光成像.
- 在癌症研究中的瘤微环境分析.
- 先进的成像技术的临床前研究应用.
背景情况:
- 空间蛋白质组学分析揭示了组织微环境中的细胞类型和相互作用.
- 芬诺Cycler是一种多重免疫光成像技术,使用寡核酸条形编码抗体.
- 现有的PhenoCycler面板主要用于新鲜冷的组织,限制使用甲固定嵌 (FFPE) 组织.
研究的目的:
- 提出一个新的PhenoCycler小组,由28个针对小鼠FFPE组织的验证抗体组成.
- 描述抗体验证,条形码,面板设计和多重成像的工作流程.
- 应用面板和分析管道来研究黑色素瘤免疫治疗中的纳米颗粒配方.
主要方法:
- 为FFPE组织选择和验证抗体克隆.
- 针对循环免疫光的抗体的寡核酸条形编码.
- 使用PhenoCycler系统进行多重成像.
- 单细胞蛋白质组学数据分析,包括集群和空间关系量化.
主要成果:
- 4-1BBL和IL-12的基因输送转移了巨细胞的两极分化,并增加了CD8 T细胞与巨细胞的相互作用.
- 添加干扰素可以增强抗原呈现和PD-L1表达.
- 干扰素也促进了更紧密的CD8 T细胞和瘤细胞相互作用,这可能解释了治疗限制.
结论:
- 开发的PhenoCycler面板对于分析小鼠FFPE组织非常有效.
- 基因传递策略可以调节瘤的免疫微环境.
- 了解这些空间动态为免疫疗法的有效性和局限性提供了机械洞察力.
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