用于ddPCR检测急性淋巴细胞白血病中最小残留疾病的分析质量控制

科学领域:

• 分子生物学分子生物学
• 临床诊断 临床诊断 临床诊断
• 癌症研究 癌症研究

背景情况:

• 滴滴数字PCR (ddPCR) 提供了在急性淋巴细胞白血病 (ALL) 中最小残留疾病 (MRD) 的绝对量化.
• 缺乏全面的质量保证计划阻碍了对MRD的ddPCR的临床实验室应用.
• 现有的实时定量PCR (qPCR) 准则需要针对ddPCR进行调整,特别是在没有标准曲线的滴滴生成和测试变异方面.

研究的目的:

• 开发和评估分析质量控制 (QC) 用于基于ddPCR在ALL中检测MRD.
• 将现有的 Ig/TCR 基因重排的 qPCR 试验调整为 ddPCR 平台.
• 建立用于滴滴生成,控制基因性能和患者特异性标记器性能的QC指标.

主要方法:

• 迁移了六个qPCRMRD试验和一个白蛋白控制基因试验到ddPCR平台.
• 使用调整的ddPCR试验测试了来自6名ALL患者的82个缓解样本.
• 开发和评估了三个分析质量控制:DN-QC,Alb-QC和PS-QC.

主要成果:

• 建立了具有通过/失败限制和ddPCRMRD检测规则的分析QC.
• ddPCR测定表明与已建立的qPCR方法具有可比的灵敏度和定量范围.
• 在qPCR和ddPCR之间在MRD结果中达到了密切一致 (91%),在可量化的样本中具有很强的一致性 (R2=0.97).

结论:

• 在ALL中成功开发了一种用于ddPCRMRD测试的新型质量控制系统.
• 这种QC系统消除了在ddPCR分析中重复标准曲线的需要.
• 开发的QC系统提供了可靠的MRD检测结果,与标准化qPCR方法相美.