描述携带等离子体介导的AmpCβ-lactamases的大肠杆菌,以优化在诊断实验室环境中的检测

科学领域:

• 临床微生物学 临床微生物学
• 分子诊断学 分子诊断
• 抗微生物耐药性 抗微生物耐药性

背景情况:

• 等离子体介导的AmpCβ-乳酸酶在格拉姆阴性细菌中赋予了头素耐药性,这给诊断带来了挑战.
• 在大肠杆菌中获得的AmpC基因的最佳检测方法尚未标准化,并且根据实验室资源和当地流行病学而有所不同.
• 在大肠杆菌中,由于相似的表型耐药性模式,难以区分获得的AmpC和内在的AmpC.

研究的目的:

• 开发和评估一种高分辨率的融PCR试验,用于检测大肠杆菌中的等离子体介导的AmpC基因 (CIT和DHA家族).
• 评估表型查标准在预测获得的AmpC基因存在方面的表现.
• 强调基因型方法对于准确识别大肠杆菌获得的AmpC耐药性的重要性.

主要方法:

• 开发并验证了一种内部高分辨率融 (HRM) PCR试验,用于检测CIT和DHA AmpC基因.
• 分析了250个E. coli分离物,具有阳性AmpC查 (cefoxitin MIC≥8 mg/L和阳性AmpC盘试验).
• 在170个分离物体上进行全基因组测序 (WGS),以确认基因型并与PCR结果进行比较.

主要成果:

• 在250个大肠杆菌分离物中,有72个 (28.8%) 携带获得的AmpC基因;PCR和WGS显示100%的一致性.
• 表型标准显示了可变的灵敏度和特异性:第1标准 (93.1%的灵敏度,47.8%的特异性),第2标准 (33.3%的灵敏度,98.9%的特异性).
• DHA基因在19%的triaxone敏感分离物中被发现,这表明仅通过表型测试就可能错过诱导性耐药性.

结论:

• 使用HRM PCR的基因型检测是识别大肠杆菌中获得的AMPC基因的可靠方法.
• 单独的表型查不足以准确检测,特别是可诱导的DHA基因.
• 区分获得的AMpC耐药性对于适当的患者管理和感染控制至关重要.