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Updated: Jun 8, 2025
04:39
Generation of a Mouse Spontaneous Autoimmune Thyroiditis Model
Published on: March 17, 2023
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与乳头甲状腺癌和哈希莫托甲状腺炎相关的生物标志物:生物信息分析和实验验证
Bingxin Li1, Zhaogen Cai2, Yihan Zhang1
1Department of Endocrinology and Metabolism, Shanghai General Hospital, Shanghai Jiao Tong University School of Medicine, Shanghai 200080, China.
International immunopharmacology
|November 7, 2024
概括
研究人员确定了MET和FAM20A作为哈西莫托甲状腺炎 (HT) 进展到乳头甲状腺癌 (PTC) 的关键基因. 这些基因显示出诊断潜力,可以区分这些甲状腺疾病.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 遗传学 是一个遗传学.
背景情况:
- 哈西莫托甲状腺炎 (HT) 是已知的甲状腺 papillary carcinoma (PTC) 的一个危险因素.
- 了解驱动HT向PTC进展的分子机制对于早期诊断和治疗至关重要.
- 识别关键的分子标可以帮助区分这些甲状腺疾病.
研究的目的:
- 确定关键的分子标,涉及哈西莫托甲状腺炎 (HT) 进展到乳头甲状腺癌 (PTC).
- 探索已识别的基因在区分HTT和PTC的诊断潜力.
主要方法:
- 从基因表达综合 (GEO) 数据库中使用的微阵列数据集 (GSE138198) 用于PTC,HT和带HT的PTC (PTC-W) 样本.
- 进行了差异基因表达 (DEG) 分析,功能丰富 (GO,KEGG) 和蛋白质与蛋白质相互作用 (PPI) 网络分析,以确定枢纽基因.
- 使用定量实时PCR (qPCR) 和免疫组织化学 (IHC) 验证的枢纽基因表达,然后进行接收器操作特征 (ROC) 分析以进行诊断评估.
主要成果:
- 在正常和患病的甲状腺组织之间确定了78个共享的差异表达基因 (DEG).
- 突出显示的途径包括表皮细胞转移到介质细胞 (EMT) 和PI3K-Akt信号传递,其中与树突细胞和巨细胞等免疫细胞相关的枢纽基因.
- 在PTC-W中确认了MET和FAM20A的过度表达,通过ROC分析实现了高诊断准确性 (MET的AUC为0.889,FAM20A的0.825).
结论:
- 确定了MET和FAM20A作为HT到PTC进展中的重要枢纽基因.
- 这两种基因显示出作为诊断生物标志物的潜力,用于区分HT和PTC.
- 对MET和FAM20A的进一步研究可能会导致改善甲状腺癌的诊断策略.
