使用QuPath和Cellpose量化心脏组织组成:一种可访问的方法来进行死后诊断.
Pernille Heimdal Holm1, Kristine Boisen Olsen1, Richard Denis Maxime De Mets2
1Section of Forensic Pathology, Department of Forensic Medicine, Faculty of Health and Medical Sciences, University of Copenhagen, Copenhagen, Denmark.
Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
|November 10, 2024
概括
一个自动化管道量化心脏组织死后的变化,帮助诊断心律失常心肌病. 这种方法提供了一个免费的,可重复的模板,用于对心脏病进行公正的评估.
科学领域:
- 法医病理学 法医病理学
- 心血管病理学心血管病理学
- 数字病理学数字病理学
背景情况:
- 突然心脏病死亡往往是潜在心脏病的第一个症状.
- 诊断心律失调性心肌病死后是具有挑战性的,因为可变的结构变化.
- 隐性心肌病,通过基因型诊断,缺乏确定的死后结构发现.
研究的目的:
- 开发和验证一个自动化的数字病理学管道,用于量化死后心脏组织.
- 在死后的心脏样本中评估心肌纤维化,残留心肌和脂肪细胞.
- 建立一种可重复的方法,用于对死后心脏病的公正评估.
主要方法:
- 使用QuPath和Cellpose开发了一个自动化管道用于图像分析.
- 皮克罗西里乌斯红色染色被用来量化原蛋白,心肌和脂肪细胞.
- 该管道在被解剖的个体的心脏组织上进行了测试,包括心律失常心肌病症病例和对照.
主要成果:
- 自动化管道成功量化了死后心脏组织中的原蛋白,心肌和脂肪细胞.
- 这种方法提供了一种定量方法来分析反应性心脏变化.
- 开发的管道是免费的,易于实施,并作为其他研究的模板.
结论:
- 自动化管道为死后心脏组织分析提供了一种新的,公正的方法.
- 这种方法可以帮助制定死后心脏病的定量诊断标准.
- 该方法促进了对心脏测量的有效评估,特别是在罕见的疾病,如心律失常心肌病.


