通过散装分离剂RNA-Seq揭示小麦中粉状菌的耐药表达特征

科学领域:

• 植物病理学 植物病理学
• 小麦遗传学 小麦遗传学
• 分子生物学分子生物学

背景情况:

• 发展小麦品种,耐受粉 (由Blumeria graminis f. sp. 引起) 的耐久性. 对于可持续的农业来说,这种农业 (tritici, Bgt) 是非常重要的.
• 小麦基因型MYC对Bgt分离物E09.0的种苗具有很高的耐药性.
• 一个衰退基因,PMMYC,被确定为这种耐药性的负责人,需要了解分子机制来进行繁殖.

研究的目的:

• 确定在小麦MYC.基因型中赋予粉耐药性的遗传区域和候选基因.
• 了解由PmMYC基因介导的抵抗的分子基础.
• 为培育耐用粉状菌耐药小麦品种提供目标.

主要方法:

• 大量分离RNA-Seq (BSR-Seq) 识别候选基因区域并分析差异性基因表达.
• 基因本体学 (GO),KEGG和COG分析以了解差异表达基因的功能.
• 实时PCR用于验证耐药和易受性小麦基因型中的基因表达特征.

主要成果:

• 在小麦染色体2B上,BSR-Seq确定了两个对PmMYC的高可信度候选区域.
• 在Bgt感染后观察到许多替代拼接事件,表明宿主拼接的潜在破坏.
• 不同表达的基因在"对刺激的反应"和"免疫系统过程"中得到丰富,特定的基因在耐药MYC中表现出明显的表达.
• 在确定的间隔内,候选基因参与了植物病原体相互作用,证实PmMYC启动了广泛的免疫反应.

结论:

• 确定了小麦对Bgt耐药性的关键遗传间隔和候选基因.
• 具有改变表达特征的基因是培养持久粉耐药性的有价值的标.
• 这些发现有助于更好地了解小麦粉相互作用,并支持未来的遗传研究.