一种基于细胞的查试验,用于针对rRNA的药物发现.

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 药理学 药理学是指药理学的学科.
• 生物化学 生物化学

背景情况:

• 细菌抗生素耐药性是一个日益增长的全球健康威胁,需要新的药物开发策略.
• 目前的药物发现方法在快速选活细胞中的新型抗菌化合物方面面临挑战.
• 光探针为可视化和量化微生物中的药物向相互作用提供了一个有希望的途径.

研究的目的:

• 开发和优化以细胞为基础的光测试,以快速选氨基糖类抗生素候选药物.
• 描述活细胞中氨基糖化物与细菌核糖体RNA (rRNA) 的结合 afinities.
• 为了评估测试对浮游生物细菌和生物膜的性能.

主要方法:

• 一个光氨基糖化物探针被设计为在大肠杆菌细胞中积累.
• 光探针被潜在的候选药物的竞争性取代被通过光强度测量.
• 试验优化侧重于信号与背景比,可靠性和高通量选兼容性.
• 测试的灵敏度和性能使用各种已知的氨基糖化物以及对浮游生物细胞和生物膜进行了评估.

主要成果:

• 光探针的积累和位移与氨基糖化物与16S rRNA A位点的结合亲和力相关.
• 对于测试的氨基糖化物,建立了明确的结合亲和关系等级,其中新氨基显示出最高亲和关系.
• 该试验表现出高灵敏度和优异的性能 (浮游生物细胞的平均Z'因子为0.80,生物膜的平均Z'因子为0.61).

结论:

• 开发的基于细胞的光检测方法能够快速,直接描述活细菌细胞中氨基糖化物结合的特性.
• 这种测试对高通量查和新型核糖体结合抗生素的鉴定具有重大潜力.
• 在浮游生物和生物膜状态下测试的有效性突出显示了它在各种生理学环境中对抗抗生素耐药性的有用性.