使用固定冷小鼠大脑部分进行Xenium空间转录学研究的协议
Xiaokuang Ma1, Peng Chen1, Jing Wei1
1Basic Medical Sciences, University of Arizona College of Medicine-Phoenix, Phoenix, AZ, USA.
STAR protocols
|November 13, 2024
概括
这项研究引入了Xenium空间转录组的新协议,用于固定冷的小鼠大脑部分. 该方法确保与Xenium平台的兼容性,产生高质量的基因表达数据.
科学领域:
- 神经科学是一个神经科学.
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 空间转录学使得在组织的细胞环境中研究基因表达成为可能.
- 该Xenium平台提供高分辨率的空间基因表达分析.
- 标准协议通常使用甲固定嵌 (FFPE) 或新鲜冷组织.
研究的目的:
- 介绍一个Xenium空间转录组的协议,使用固定冷的小鼠大脑部分.
- 为了证明固定冷部分与Xenium平台的兼容性.
- 为了验证通过这种方法获得的基因表达数据的质量.
主要方法:
- 鼠标大脑的内心 perfusion. 鼠标大脑的内心 perfusion. 鼠标大脑的内心 perfusion. 鼠标大脑的内心 perfusion.
- 固定冷脑组织的冷切割.
- 浮式部分安装用于Xenium分析器兼容性.
主要成果:
- 固定冷的小鼠大脑部分与Xenium空间转录组学平台兼容.
- 该协议产生了出色的成像结果.
- 实现了空间解析基因表达的准确量化.
结论:
- 开发的协议扩展了Xenium平台对空间转录学的实用性.
- 固定冷部分为Xenium研究提供了可行的替代方案,提供了高质量的数据.
- 这种方法有助于对小鼠大脑中的基因表达模式进行详细分析.
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