基于变压器的深度学习模型用于在初级保健中诊断疑似肺癌,该模型基于电子健康记录数据
Lan Wang1, Yonghua Yin2, Ben Glampson3
1Dept of Mathematics, Imperial College London, UK.
EBioMedicine
|November 13, 2024
概括
这项研究开发了一种使用电子健康记录的深度学习模型,以改善早期肺癌检测. 该模型通过分析患者护理途径显著提高了预测准确性,为初级保健提供了一个有前途的工具.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 医疗信息学 医疗信息学
- 机器学习 机器学习
背景情况:
- 肺癌是英国癌症死亡的主要原因,通常是晚期诊断出来的.
- 目前的风险模型具有有限的积极预测值 (PPV),并且不利用连续的电子健康记录 (EHR) 数据.
- 需要先进的模型来捕捉患者护理途径中的时间关系,以便早期检测肺癌.
研究的目的:
- 开发和评估用于初级保健中早期肺癌检测的机器学习模型.
- 利用深度"变压器"模型来分析复杂的顺序EHR数据和患者护理途径.
- 通过纳入时间数据动态来改进现有的流行病学风险模型.
主要方法:
- 使用全系统综合护理 (WSIC) 数据集 (3303992名患者,1981-2020年) 设计了一项病例控制研究.
- 深度学习 (ALBERT与后勤回归分类器头) 应用于诊断前三年的语义预处理的EHR数据.
- 用AUROC和PPV来评估模型性能,并使用比较器回归模型进行基准测试.
主要成果:
- 变压器模型实现了0.924的AUROC和3.6%的PPV,超过了对比器回归模型 (AUROC0.887,PPV3.1%) 的表现.
- 该模型使用诊断前三年的EHR数据 (不包括最后一个月) 显示了86.6%的灵敏度.
- 集群分析根据肺癌进展和临床调查模式确定了六个不同的患者组.
结论:
- 将时间序列纳入患者护理途径显著提高了肺癌检测模型的准确性.
- 开发的模型显示了改善初级保健机构早期肺癌诊断的潜力.
- 未来的研究将集中在外部验证和整合到全科医生 (GP) 临床系统.


