基于参与阿拉基酸代谢的七个基因,对肝细胞癌的预测性预后模型
Xinyu Gu1, Jing Wang1, Jun Guan1
1State Key Laboratory for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases, National Clinical Research Center for Infectious Diseases, National Medical Center for Infectious Diseases, Collaborative Innovation Center for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases, the First Affiliated Hospital, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou, China.
一个新的七基因模型预测肝细胞癌 (HCC) 患者的生存率和免疫治疗反应. 这种基于阿拉基酸代谢基因的模型,为HCC提供了更好的预后准确性,HCC是一种往往结果差的癌症.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 基因组学就是基因组学.
- 代谢学 代谢学 代谢学
背景情况:
- 肝细胞癌 (HCC) 呈现出隐性发作和快速进展,导致整体生存率 (OS) 较差.
- 目前的HCC预后模型缺乏令人满意的预测效果.
- 阿拉基酸代谢与炎症,再生,免疫调节和瘤发生有关.
研究的目的:
- 构建和验证基于参与酸代谢的七个基因对HCC的预后预测模型.
- 评估HCC预后和免疫治疗反应的开发模型的预测稳定性和有效性.
主要方法:
- 利用来自365名HCC患者 (TCGA,HCCDB18,GSE14520,GSE76427) 的基因组数据进行培训和验证.
- 雇员共识ClusterPlus用于基于12个酸代谢基因的样本聚类.
- 使用考克斯和拉索回归确定了与预后相关的枢纽基因 (CYP2C9,G6PD,CDC20,SPP1,PON1,TRNP1,ADH4).
- 进行免疫组织化学 (IHC) 和瘤免疫微环境评估 (ESTIMATE,ssGSEA,TIDE).
主要成果:
- HCC样本被分为三个集群,具有不同的OS率;集群2有最好的预后,集群1最差.
- 七个枢纽基因 (CYP2C9,G6PD,CDC20,SPP1,PON1,TRNP1,ADH4) 形成了一个简化的预后模型.
- 高风险组的预后明显恶化,免疫疗法疗效降低.
- 开发的模型表现出稳定的预后预测功效.
结论:
- 一个七基因模型有效地预测HCC的预后.
- 这种模型还显示了在预测患者对免疫疗法的反应方面具有实用性.
- 这些发现为肝细胞癌提供了更稳定,更准确的预后工具.
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