BIFROST:一种用于注册多种成像数据集的方法,该数据集包含Drosophila大脑的各种成像数据集

科学领域:

• 神经科学是一个神经科学.
• 生物物理学的生物物理.
• 计算生物学 计算生物学

背景情况:

• 在不同模式和样本类型 (活体与固定) 中比较功能和解剖脑成像是具有挑战性的.
• 由于成像和样本准备的差异,在体内功能性成像数据与体外参考地图书的准确对齐是困难的.
• 精确对准常见的解剖坐标对于比较大脑范围的神经动态和与基因表达模式和连接体等资源集成至关重要.

研究的目的:

• 为了克服在不同模式和样本准备中注册功能和解剖脑成像数据的挑战.
• 开发一种标准化的管道,用于将神经成像数据转化为果大脑的共同解剖空间.
• 为了使多样化的ex vivo资源,如连接体,与in vivo功能数据的整合.

主要方法:

• 从多光子成像的果大脑构建一个体内参考图书馆,功能性Drosophila图书馆.
• 在统计模板上进行注册的桥梁 (BIFROST) 管道的开发,用于神经成像数据的注册.
• 利用基因标记的细胞类型作为验证注册准确性的基本事实.

主要成果:

• 成功开发了功能性多虫图谱作为体内参考.
• 实施BIFROST管道用于转换和调整神经成像数据.
• 使用基因标记的细胞类型,证明注册精度小于10微米.

结论:

• BIFROST提供了一个强大的管道,用于在Drosophila中注册功能成像数据集.
• 开发的地图集和管道有助于精确对准体内和体外大脑数据.
• 这一进步使神经动力学和与实验中的和实验中的解剖学资源的整合能够更准确地进行比较.