2019年10月至2020年3月期间,在亚利桑那州 (美国) 使用基于废水的流行病学,长距离PCR和病原体测序,在亚利桑那州 (美国) Adenovirus 41的多样性
Temitope O C Faleye1, Peter Skidmore2, Amir Elyaderani2
1Biodesign Center for Environmental Health Engineering, Biodesign Institute, Arizona State University, Tempe, AZ85287, USA.
Epidemiology and infection
|November 18, 2024
概括
与儿科肝炎相关的41型腺病毒 (A41) 菌株在2019年在美国的废水中传播,早于其2021年识别. 还检测到其他A41血统,其中一些尚未在人类病例中发现.
科学领域:
- 环境微生物学环境微生物学
- 病毒学 病毒学
- 流行病学 流行病学
背景情况:
- 2021年未能解释的儿科肝炎病例促使对潜在的病原体进行调查.
- 亚地诺病毒41型 (A41) 被确定为这些病例的潜在贡献者.
研究的目的:
- 通过废水监测,调查美国A41血统的历史存在和多样性.
- 为了确定在2021年肝炎病例之前的A41的潜在来源和循环模式.
主要方法:
- 利用远程聚合酶链反应 (PCR) 进行向基因放大.
- 基于废水的应用流行病学 (WBE) 分析污水中的病原体存在.
- 使用下一代测序用于病原体基因组分析.
主要成果:
- 确定了与2021年儿科肝炎相关的A41六子序列系,早在2019年就在美国废水中循环.
- 在废水样本中检测到额外的A41系,包括那些在临床环境中尚未记录完整基因组的人.
- 证明了WBE在早期检测和追踪病毒病原体方面的实用性.
结论:
- 在2021年肝炎疫情爆发之前,A41在美国已经流传了至少两年.
- 废水监测为监测病毒循环和识别新型或报告不足的病原体系谱提供了宝贵的工具.
- 需要进一步的研究来充分描述新发现的A41血统及其潜在的临床意义.


