基于模式的基因组挖掘指导了从海洋链杆菌体中发现的抗生素 indanopyrrole A 的发现

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 自然产品化学 自然产品化学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 杆菌是丰富的天然产品生产者,海洋衍生菌株尚未得到充分探索.
• 海洋链杆菌的MAR4类是已知的新型化化合物的来源.

研究的目的:

• 为了探索海洋衍生的Streptomyces的生物合成潜力.
• 发现来自MAR4类的新天然产品.
• 为了研究化洛基胺的生物合成.

主要方法:

• 基于模式的基因组挖掘MAR4类基因组.
• 生物信息分析将化合物与生物合成基因集群 (BCG) 联系起来.
• 对BCG进行比较分析.

主要成果:

• 发现了第一种化罗基基胺天然产品,即罗基烯A和B.
• 在20个MAR4基因组中发现的indanopyrroles与孤儿BCG的联系.
• 印度诺皮罗尔A证明了强大的宽谱抗生素活性.
• 洞察到pyrroloketoindane生物合成,循环和卸载机制.

结论:

• 海洋衍生的链状菌种,特别是MAR4类,具有显著的未开发的生物合成潜力.
• 在danopyrroleBCG是罕见的,表明独特的进化起源和潜在的新化合物发现.
• 印度诺皮罗尔A为抗生素开发提供了一个有前途的化合物.