对猪热应激引起的肠炎的转录组分析的见解和影响
Zhichao Yu1, Yanhong Yong1, Xiaoxi Liu1
1College of Coastal Agricultural Sciences, Guangdong Ocean University, Zhanjiang, 524088, China.
BMC genomics
|November 20, 2024
概括
热应激会导致猪的肠道炎症. 这项研究确定了关键基因和参与这种炎症反应的长非编码RNA (lncRNA),为其分子机制提供了洞察力.
科学领域:
- 动物生理学和分子生物学
- 基因组学和生物信息学
- 兽医免疫学 兽医免疫学
背景情况:
- 热应激 (HS) 显著影响动物生理学,导致诸如猪肠道炎症等疾病.
- 由HS引起的肠道炎症导致严重的腹和猪业的重大经济损失.
- 精确的分子机制和HS诱导的肠道炎症的致病性仍然不完全理解.
研究的目的:
- 为了确定差异表达基因 (DEGs) 和差异表达长非编码RNA (DELs),与在恒定的热应激下猪结肠组织的炎症相关.
- 阐明导致猪热应激引起的肠炎的分子机制.
主要方法:
- 在不同的时间点 (1,7,14天) 进行对照和热应激猪结肠组织的比较转录基因分析.
- 构建针对 lncRNA 的基因相互作用网络.
- 基因本体学 (GO) 标注和基因和基因组的京都百科全书 (KEGG) 对DEG和DEL的途径分析.
主要成果:
- 在不同的热应力持续时间内发现了大量的DEG和DEL.
- 关键基因 (例如,KRT85,CLDN1,S100A12) 和lncRNAs与调节肠道炎症有关.
- 丰富分析显示,它涉及天生的免疫反应,RAGE受体结合,ERK1/2级联,紧密结合和MAPK信号通路.
结论:
- 这项研究扩大了对受热压力的猪中结肠炎症相关基因和lncRNA生物学的理解.
- 该研究提供了在HS诱导的肠道炎症的背景下对lncRNA-mRNA相互作用的全面分析.
- 这些发现为了解猪对热应激的肠道反应的分子基础提供了宝贵的参考资料.
